Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb6Q60692 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms