Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms