Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms