Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbs12Q5SUD9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbs12Q5SUD9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms