Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms