Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms