Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
H2al1nQ497L1 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms