Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrc43Q3V0L5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms