Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms