Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms