Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms