Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms