Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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