Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms