Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms