Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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