Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Otud5Q3U2S4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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