Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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