Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms