Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms