Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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