Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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