Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VgfQ0VGU4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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