Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms