Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrioQ0KL02 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms