Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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