Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnb1Q03717 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnb1Q03717 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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