Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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NfiaQ02780 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NfiaQ02780 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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