Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms