Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms