Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms