Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms