Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms