Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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