Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms