Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Irx3P81067 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx3P81067 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms