Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NfixP70257 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NfixP70257 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NfixP70257 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NfixP70257 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NfixP70257 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NfixP70257 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NfixP70257 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NfixP70257 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NfixP70257 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NfixP70257 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NfixP70257 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms