Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NficP70255 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NficP70255 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NficP70255 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NficP70255 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NficP70255 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NficP70255 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms