Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp46P62069 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp46P62069 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms