Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms