Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2nP61089 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms