Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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CdaP56389 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CdaP56389 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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