Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms