Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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