Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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