Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VdrP48281 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
VdrP48281 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VdrP48281 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
VdrP48281 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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VdrP48281 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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VdrP48281 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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