Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rplp1P47955 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms