Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SrprbP47758 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SrprbP47758 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SrprbP47758 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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SrprbP47758 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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SrprbP47758 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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