Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mmp9P41245 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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