Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtlP38585 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TtlP38585 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms